Nació en Gualeguay, Entre Ríos, el 27 de mayo de 1879. Sus padres eran oriundos del País Vasco. Desde pequeño comenzó a mostrar su natural vocación hacia el dibujo y a los 13 años ingresó en el taller del valenciano Vicente Nicolau Cotanda. Tres años más tarde continuó sus estudios en la Academia de la Sociedad Estímulo de Bellas Artes, bajo la tutela de los maestros Ángel Della Valle, Lucio Correa Morales, Reinaldo Giudici y Ernesto de la Cárcova. En noviembre de 1899 ganó una beca para viajar a Italia con el objetivo de perfeccionar sus conocimientos. En 1905 se estableció en España, donde se vinculó con los maestros Ignacio Zuloaga y Joaquín Sorolla. Regresó a la Argentina en 1906 e integró Nexus. Pertenecieron a este grupo Pío Collivadino, Carlos Ripamonte, Alberto Rossi, Fernando Fader, Ernesto de la Cárcova y Eduardo Sívori, jóvenes que ‘si bien habían recibido una formación académica’ dieron un giro al valorar de manera explícita los rasgos nacionales, acompañando los cambios sociales que se estaban gestando en el país. En la Exposición Internacional del Centenario, obtuvo el Gran Premio y Medalla de Oro (1910). Esta muestra fue consagratoria para Quirós, ya que le destinaron una sala completa dedicada a sus pinturas. Años más tarde se retiraría a un campo en la provincia de Entre Ríos, donde habría de realizar su obra más conocida, una serie de pinturas a las que llamó Los gauchos y en las que reflejó el espíritu, la historia, las costumbres y los personajes de la tierra. Estas obras fueron exhibidas en Buenos Aires en 1928 y luego recorrieron con gran éxito España, Alemania, Inglaterra, Francia y los Estados Unidos. La gira se prolongó hasta 1936, año en que Quirós regresó definitivamente al país. Fue presidente de la Academia Nacional de Bellas Artes. El pintor Cesáreo Bernaldo de Quirós murió en la localidad de Vicente López, pcia. de Buenos Aires, el 29 de mayo de 1968.